YellowDog使用162120核心超级计算机
在药物发现,与许多生命科学的,数据是关键。数据集的大小和分析的质量对给定药物开发计划的成功有重要影响。
云提供了巨大的潜力来帮助药物发现,因为它使公司能够动态扩展其研究并分析比内部部署基础架构更多的数据。
OMass Therapeutics看到了利用哈佛大学的 REAL数据库和YellowDog的多云工作负载管理解决方案来加速其虚拟筛选功能的机会。通过访问按需超级计算机,OMass可以停泊500倍以上的虚拟化合物,并显着丰富了所筛选化合物的前10%。这项顶级分析使OMass能够将注意力集中在针对其特定药物靶标的最可能的活性分子上。
凭借用于虚拟筛选的4.77亿个分子的精炼清单,YellowDog提供了:
YellowDog Sigma用于在四个区域中快速配置和智能编排2,000个AWS竞价型实例,共162,120个核心。
任务分配和重新分配。
YellowDog Assura和YellowDog索引可确定针对此工作负载的最佳计算来源。
与用于分子对接的开源应用程序AutoDock Vina集成。
使用YellowDog对象存储进行安全存储和数据检索。
结果非常出色:
在22.5小时内分析并筛选了4.77亿种化合物。使用OMass的现有设置,相同的分析将花费一年的时间。
YellowDog Assura为工作负载节省了56.9%的云计算成本。
YellowDog Sigma在10分钟内配置了2,000个AWS实例。使用标准调度程序或云配置程序通常需要13个小时。
在此早期阶段进行的分子对接分析数量的根本顺序变化,将有助于显着缩短OMass识别前导化合物所需的时间,并为患者带来改变生活的益处。
关于
OMass Therapeutics是一家牛津生物技术公司,从牛津大学分离出来,利用本地质谱法和其他生物物理技术来推动高清晰度药物研发。
YellowDog借助其世界一流的混合和多云工作负载管理平台来扩展,控制和优化计算。YellowDog利用最佳计算资源满足客户的个性化需求,从而按时按预算交付工作负载。